May 2 · 8 min read · OpenAI launched GPT-Rosalind on April 16, 2026 — a specialized reasoning model built from the ground up for biology, drug discovery, and translational medicine research. Named after British chemist Rosalind Franklin, whose X-ray crystallography work ...
Join discussionApr 12 · 14 min read · Where and how did it all start Imagine being handed a spreadsheet with 60,000 columns and being told — somewhere in here is the answer to classifying a cancer that kills 9 out of 10 patients within fi
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Mar 24 · 2 min read · At a glance: 40+ MCP servers across genomics, proteomics, drug discovery, clinical trials, medical imaging, and healthcare interoperability. Integrated platforms lead: biomcp (241 stars) and Anthropic's life-sciences marketplace (259 stars). Rating: ...
Join discussionMar 4 · 5 min read · Scikit-allel 群體遺傳學分析工具完整評測 Scikit 如果你是做生物資訊學或演化基因組學研究，一定遇過這些困擾： PLINK 功能強但不靠 Python，難以整合自己的分析流程 R 套件記憶體吃不消，處理 100 萬變異要跑一整天 自己寫 Python 指令碼，重複造輪子，效率低 這幾天測試了 scikit-allel，一個專為群體遺傳學設計的 Python 套件，先講結論：效能與 PLINK 不相上下，靈活性遠超其他工具。 為什麼需要 scikit-allel？ ...
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Feb 28 · 3 min read · pysam、cyvcf2、PyVCF3 性能對比與應用 BAM Viewer 在生物資訊的世界裡，處理基因組變異數據是在日常不過的工作，從最入門的PyVCF3 再到 pysam 除了可以除了vcf外，還可以一並處理GATK前後處理，再到 cyvcf2 可以處理大型WGS檔案以及批次同時處理多個VCF檔，到底要怎麼選？ 1. pysam (0.23.3) 這是最一開始Agent推薦給我的tools，支援常見的格式檔案，SAM、BAM、CRAM、VCF、BCF，也可以直接呼叫 samtools/...
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Feb 27 · 2 min read · PrimateAI-3D 變異預測完全指南 Illumina PrimateAI-3D 在精準醫學時代，解讀基因變異是診斷罕見疾病的關鍵。但問題是要怎麼區分真正危險的變異 vs. 無害的背景變異？ 如果 Google AlphaMissense 從「蛋白質結構」出發，那麼 Illumina PrimateAI-3D 的最主要的邏輯就是在演化。 Illumina 的科學家們定序了 233 種靈長類動物。他們的假設很簡單：如果一個變異在猴子、猩猩身上都找不到，代表這個變異在演化過程中被「淘汰」了，...
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